Next generation sequencing (NGS) te

Next generation sequencing (NGS) technologies provide a high-throughput means to generate large amount of sequence
data. However, quality control (QC) of sequence data generated from these technologies is extremely important for
meaningful downstream analysis. Further, highly efficient and fast processing tools are required to handle the large volume
of datasets. Here, we have developed an application, NGS QC Toolkit, for quality check and filtering of high-quality data. This
toolkit is a standalone and open source application freely available at http://www.nipgr.res.in/ngsqctoolkit.html. All the
tools in the application have been implemented in Perl programming language. The toolkit is comprised of user-friendly
tools for QC of sequencing data generated using Roche 454 and Illumina platforms, and additional tools to aid QC
(sequence format converter and trimming tools) and analysis (statistics tools). A variety of options have been provided to
facilitate the QC at user-defined parameters. The toolkit is expected to be very useful for the QC of NGS data to facilitate
better downstream analysis.

Results (Thai) 1:

ลำดับ (NGS) เทคโนโลยีรุ่นต่อไปให้ส่งผ่านสูงหมายถึงการสร้างจำนวนมากของลำดับ
ข้อมูล แต่การควบคุมคุณภาพ (QC) ของข้อมูลลำดับที่สร้างขึ้นจากเทคโนโลยีเหล่านี้เป็นสิ่งสำคัญอย่างยิ่งสำหรับการวิเคราะห์ความหมาย
ล่อง เพิ่มเติมเครื่องมือการประมวลผลประสิทธิภาพสูงและรวดเร็วจะต้องจับปริมาณมาก
ของชุดข้อมูล ที่นี่เราได้พัฒนาโปรแกรมประยุกต์ NGS QC ชุดเครื่องมือสำหรับการตรวจสอบคุณภาพและการกรองข้อมูลที่มีคุณภาพสูง นี้
เครื่องมือเป็นแบบสแตนด์อโลนและการประยุกต์ใช้โอเพนซอร์สได้อย่างอิสระที่มีอยู่ใน http://www.nipgr.res.in/ngsqctoolkit.html ทั้งหมด
เครื่องมือในการสมัครที่ได้รับการดำเนินการในการเขียนโปรแกรมภาษา Perl ที่ ชุดเครื่องมือประกอบด้วยใช้งานง่าย
เครื่องมือสำหรับการควบคุมคุณภาพของข้อมูลที่สร้างขึ้นโดยใช้ลำดับโรช 454 และ Illumina แพลตฟอร์มและเครื่องมือเพิ่มเติมเพื่อช่วย QC
(แปลงรูปแบบลำดับและตัดเครื่องมือ) และการวิเคราะห์ (เครื่องมือทางสถิติ) ความหลากหลายของตัวเลือกที่ได้รับการไว้เพื่ออำนวยความสะดวก
QC พารามิเตอร์ที่ผู้ใช้กำหนด เครื่องมือที่คาดว่าจะมีประโยชน์มากสำหรับ QC ของข้อมูล NGS เพื่ออำนวยความสะดวกการวิเคราะห์
ล่องดีกว่า

Results (Thai) 2:

รุ่นต่อไปให้จัดลำดับ (NGS) เทคโนโลยีสูงสูงหมายถึง การสร้างจำนวนลำดับ
ข้อมูล อย่างไรก็ตาม การควบคุมคุณภาพ (QC) ของข้อมูลลำดับที่สร้างจากเทคโนโลยีเหล่านี้เป็นสิ่งสำคัญมากสำหรับ
การวิปลายน้ำ เพิ่มเติม เครื่องมือประมวลผลที่รวดเร็ว และมีประสิทธิภาพสูงจะต้องจัดการจำนวนมาก
ของ datasets ที่นี่ เราได้พัฒนาโปรแกรมประยุกต์ ชุดเครื่องมือ NGS QC สำหรับการตรวจสอบคุณภาพและการกรองข้อมูลคุณภาพ นี้
เครื่องมือเป็นแบบสแตนด์อโลนและแหล่งเปิดโปรแกรมประยุกต์ได้อย่างอิสระมี http://www.nipgr.res.in/ngsqctoolkit.html ทั้งหมด
เครื่องมือในโปรแกรมประยุกต์ใช้งานในภาษาเพิร์ลภาษาการเขียนโปรแกรม เครื่องมือประกอบด้วยการใช้งานง่าย
เครื่องมือสำหรับการ QC ของลำดับเบสข้อมูลที่สร้างขึ้นโดยใช้แพลตฟอร์ม Roche 454 และ Illumina และเครื่องมือเพิ่มเติมเพื่อช่วย QC
(ลำดับแปลงรูปแบบและเครื่องมือตัดแต่ง) และวิเคราะห์ (เครื่องมือสถิติ) การให้ความหลากหลายของตัวเลือก
ช่วย QC ที่พารามิเตอร์ที่ผู้ใช้กำหนด เครื่องมือคาดว่าจะมีประโยชน์มากสำหรับ QC NGS ข้อมูลเพื่ออำนวยความสะดวก
ดีวิเคราะห์ปลายน้ำ