The final step we analyze concordan

The final step we analyze concordance rate of base call between our SNP calls with array-based genotypes. We applied criterion for filtering of high-quality data and increase accuracy of base call. Criterion for filtering base call including coverage and quality score (QV), by select all SNP and divided SNP according to the coverage and QV range at >=10, >=15, >=20, >=25 and >=30.

Results (Thai) 1:

ขั้นตอนสุดท้ายเราจะวิเคราะห์อัตราความสอดคล้องของการเรียกฐานระหว่างสาย snp ของเราที่มียีนอาร์เรย์-based เราใช้เก​​ณฑ์สำหรับการกรองของข้อมูลที่มีคุณภาพสูงและเพิ่มความถูกต้องของการเรียกฐาน เกณฑ์สำหรับการโทรฐานการกรองรวมถึงการรายงานข่าวและคะแนนคุณภาพ (คิวโวลต์) โดยเลือก snp และ snp แบ่งตามการรายงานข่าวและคิวโวลต์ช่วงที่> = 10,> = 15,> = 20,> = 25 และ> = 30

Results (Thai) 2:

ขั้นตอนสุดท้ายที่เราวิเคราะห์สอดคล้องอัตราโทรพื้นฐานระหว่าง SNP เราเรียกกับอาร์เรย์โดยใช้การศึกษาจีโนไทป์ เราใช้เกณฑ์สำหรับการกรองของคุณภาพข้อมูลและเพิ่มแม่นยำโทรพื้นฐาน เกณฑ์สำหรับการกรองโทรพื้นฐานที่ครอบคลุมและคุณภาพคะแนน (QV), โดยเลือก SNP ทั้งหมด และหาร SNP ตามความครอบคลุมและช่วง QV > = 10, > = 15, > = 20, > = 25 และ > = 30