The Basic Local Alignment Search To

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between protein or nucleotide sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence in a database and calculates the statistical significance of the matches. This chapter first provides an introduction to BLAST and then describes the practical application of different BLAST programs based on the BLAST Quick Start mini-course (www.ncbi.nlm.nih.gov/Class/minicourses). In each example, emphasis is placed on practical step-by-step procedures, although relevant theory is also given where it affects the choice of BLAST program, parameters, and database.

Results (Indonesian) 1:

Dasar lokal keselarasan pencarian Tool (LEDAKAN) menemukan daerah setempat kesamaan antara urutan protein atau nukleotida. Program membandingkan nukleotida atau protein urutan urutan dalam database dan menghitung signifikansi Statistik pertandingan. Bab ini pertama menyediakan pengenalan LEDAKAN dan menggambarkan aplikasi praktis dari program LEDAKAN yang berbeda berdasarkan LEDAKAN cepat mulai kursus mini (www.ncbi.nlm.nih.gov/Class/minicourses). Dalam setiap contoh, penekanan pada prosedur langkah-langkah yang praktis, meskipun relevan teori juga diberikan di mana itu mempengaruhi pilihan program LEDAKAN, parameter dan database.

Results (Indonesian) 2:

Dasar Lokal Penyelarasan Search Tool (BLAST) menemukan daerah kesamaan lokal antara protein atau nukleotida urutan. Program ini membandingkan nukleotida atau protein urutan ke urutan dalam database dan menghitung signifikansi statistik pertandingan. Bab ini pertama memberikan pengenalan BLAST dan kemudian menjelaskan aplikasi praktis dari program BLAST yang berbeda berdasarkan BLAST Quick Start mini-kursus (www.ncbi.nlm.nih.gov/Class/minicourses). Dalam setiap contoh, penekanan ditempatkan pada prosedur langkah-demi-langkah praktis, meskipun teori yang relevan juga diberikan di mana hal itu mempengaruhi pilihan program BLAST, parameter, dan basis data.