Finally we applied QC criterion for

Finally we applied QC criterion for estimated the accuracy SNP calling both Coverage and Phred quality score (QV) by select coverage 10 and QV 20. The result of the concordance rates between our SNV call and the SNP genotyping were 95.26% for homozygous wild type, 95.25% for homozygous mutant SNPs and 98.82% for heterozygous SNPs

Results (Thai) 1:

สุดท้ายเราใช้เก​​ณฑ์การประเมินคุณภาพความถูกต้อง snp เรียกทั้งความคุ้มครองและคะแนนคุณภาพ phred (คิวโวลต์) โดยเลือกความคุ้มครองที่ 10 และ 20 คิวโวลต์ ผลของอัตราความสอดคล้องระหว่างสาย Snv องค์กรของเราและ genotyping snp เป็น 95.26% สำหรับประเภท homozygous ป่า 95.25% ใน SNPs กลายพันธุ์ homozygous และ 98.82% ใน SNPs heterozygous

Results (Thai) 2:

ในที่สุด เราใช้ QC เกณฑ์สำหรับประเมิน SNP ที่เรียกความครอบคลุมทั้งความแม่นยำ และคุณภาพ Phred คะแนน (QV) ทางเลือกครอบคลุม 10 QV 20 ผลของอัตราสอดคล้องระหว่างเราเรียก SNV และ SNP genotyping ได้ 95.26% ชนิดป่า homozygous, 95.25% homozygous mutant SNPs และ 98.82% heterozygous SNPs